培養基可分為一類和二類，一類包括基礎培養基、營養培養基和通用增菌培養基，二類包括藥敏試驗用培養基和/選擇增菌培養基。根據細菌的營養要求加入適當的生長因子或微量元素等。如堿性蛋白胨水培養基等，在取樣后和樣品處理前保護和維持微生物活性。將混有多種細菌的標本經培養而分離成單個菌落并能從中將目的菌檢出。主要根據目的菌生長繁殖需要，在基礎培養基中加入適量特殊營養成分或生長因子，或加入選擇性抑制劑，達到提高目的菌檢出率的目的。
這些培養基該如何貯藏呢？
自配的培養基應標記名稱、批號、配制日期、制備人等信息，并在已驗證的條件下貯藏。商品化的成品標簽上應標有名稱、批號、生產日期、失效期及有關特性，生產商和使用者應根據使用說明書上的要求進行貯藏，所采用的貯藏和運輸條件應使成品培養基低限度的失去水分并提供機械保護。培養基滅菌后不得貯藏在髙壓滅菌器中，瓊脂培養基不得在0℃或0℃以下存放，因為冷凍可能破壞凝膠特性。保存應防止水分流失，避光保存。瓊脂平板要現配現用，如置冰箱保存，一般不超過1周，且應密閉包裝，若延長保存期限，保存期需經驗證確定。固體培養基滅菌后只允許1次再融化，避免因過度受熱造成培養基質量下降或微生物污染。培養基的再融化一般采用水浴或流通蒸汽加熱，若采用其他溶解方法，應對其進行評估，確認該溶解方法不影響質量。融化的培養基應置于45-50℃的環境中，不得超過8小時。使用過的培養基(包括失效的）應按照國家污染廢物處理相關規定進行。
