透析袋預處理液可以用于干型透析袋的預處理過程，使用本品將干型透析袋煮沸10分鐘，再用純水煮沸10分鐘，冷卻后用純水洗凈，即可使用。處理過后的透析袋，要保存在透析袋儲存液中，如再次干燥，透析袋會被損壞。
在實驗前，透析袋要經過特殊處理才可使用，可先用50％乙醇煮沸1小時，再依次用50％乙醇、0.01 mol/L碳酸氫鈉和0.001 mol/L EDTA溶液洗滌，用蒸餾水沖洗即可使用。實驗證明，50％乙醇處理對除去具有紫外吸收的雜質特別有效。（也可先在大體積的2%（W/V）碳酸氫鈉和 1mmol/L EDTA（pH 8.0）中將透析袋煮沸10分鐘，用蒸餾水清洗后，再放在1mmol/L EDTA（pH 8.0）中將之煮沸10分鐘。）使用后的透析袋洗凈后可存于4℃蒸餾水中，確保透析袋始終浸沒在溶液內。若長時間不用，可加少量NaN2，以防長菌。從此時起取用透析袋要戴手套。洗凈涼干的透析袋彎折時易裂口，用時仔細檢查，不漏時方可重復使用。
新透析袋如不作如上的特殊處理，則可用沸水煮五至十分鐘，再用蒸餾水洗凈，即可使用。
使用時，一端用橡皮筋或線繩扎緊，也可以使用特制的透析袋夾夾緊，由另一端灌滿水，用手指稍加壓，檢查不漏，方可裝入待透析液，通常要留三分之一至一半的空間，以防透析過程中，透析的小分子量較大時，袋外的水和緩沖液過量進入袋內 將袋漲破。含鹽量很高的蛋白質溶液透析過夜時，體積增加50％是正常的。為了加速透析速度，除多次更換透析液外，還可使用磁子攪拌。透析的容器要大一些， 可以使用大燒杯、大量筒和塑料桶。小量體積溶液的透析，可在袋內放一截兩頭燒園的玻璃棒或兩端封口的玻璃管，以使透析袋沉入液面以下。
